In november 2003 is naar aanleiding van het verzoek van de Tweede Kamer besloten tot een onderzoek naar haar rol bij grote infrastructuurprojecten. Hiervoor is een tijdelijke commissie aangesteld onder het voorzitterschap van de heer Duivesteijn. Doel van het onderzoek was om aan de hand van de ervaringen met deze beide projecten een kader te schetsen voor de rol die de Tweede Kamer bij toekomstige grote projecten zou moeten spelen. Het eindrapport van de commissie is eind 2004 gepubliceerd. Gedurende het onderzoek zijn door de Projectorganisatie vele vragen beantwoord, is de onderzoekscommissie rondgeleid op de werkvloer en is de directeur Realisatie Betuweroute gehoord. Daarnaast hebben ProRail en de Projectorganisatie Betuweroute op eigen initiatief een gezamenlijke reactie gegeven aan de commissie Duivesteijn betreffende de beheersing van het project.

Op de site, ‘Parlement & Politiek', treft u informatie aan omtrent het parlementair onderzoek en kunt u de rapporten downloaden die zijn geschreven naar aanleiding van het onderzoek met o.a. de conclusies en aanbevelingen.

Het document, 'Parlementair Onderzoek reactie ProRail', bevat de reactie van de Projectorganisatie Betuweroute en ProRail, bedoeld als aanvulling op het onderzoek.

Het document ‘De lessen van Duivesteijn’ is een documentatieset die is gebruikt bij een werkconferentie op 29 juni 2005 en een forumbijeenkomst op 5 juli 2005 van de Projectorganisatie Betuweroute. Deze bijeenkomsten stonden in het teken van het  Parlementair Onderzoek waarbij dieper werd ingegaan op de uitkomsten van het onderzoek.